পরমাণু ক্ষুদ্র কণা। কারণ- পরমাণুকে ভাঙলে সেই পদার্থের আর কোন গুণাগুণ থাকে না, মানে যে পদার্থের পরমাণু ভাঙা হল, তারপর আর সে ই পদার্থের অস্তিত্ব থাকে না। এজন্য কোন মৌলিক পদার্থের ক্ষুদ্রতম কণা বলতে পরমাণুকে নির্দেশ করা হয়। যেমনটা যৌগিক পদার্থের ক্ষুদ্রতম কণা বোঝাতে অনু কে বোঝায়। অনুকে ভাঙলে যেমন কয়েকটি মৌলের পরমাণু পাওয়া যায়, কিন্তু সেই যৌগের কোন বৈশিষ্ট্য সেখানে থাকে না, তেমনি পরমাণুকে ভাঙলেও সেই মৌল সম্বন্ধে কোন ধারণা পাওয়া যায় না। তাই পরমাণু যে কোন মৌলের ক্ষুদ্রতম কণা হিসেবে অধিক পরিচিত। ইলেকট্রন, প্রোটন, নিউট্রন এই তিনটি প্রধান মৌলিক কণিকা হিসেবে বিবেচিত হয়।